Acht Generaldirektoren und neun stellvertretende Generaldirektoren haben im Zuge dieser Umbesetzung einen neuen Posten erhalten. Bei der Umbesetzung mussten Kriterien wie Verdienste und Fachwissen, Geschlecht und Nationalität berücksichtigt werden. Einige der interessantesten Neubesetzungen (ab dem 1. Januar 2006) sind die folgenden:
- Catherine Day (Irland, GD Umwelt) übernimmt als erste Frau das Amt des Generalsekretärs der Kommission und wird damit Nachfolgerin ihres Landsmannes David O’Sullivan, der zur GD Handel überwechselt
- José Manuel Silva Rodrigues (Spanien, GD Landwirtschaft) geht in die GD Forschung, wo er Achilleas Mitsos ersetzt, der Ratgeber („hors classe“) für GD Forschung wird.
- Odile Quintin (Frankreich, GD soziale Angelegenheiten), wird in die GD Bildung versetzt und in ihrem derzeitigen Amt durch Klaus van der Pas (Deutschland) ersetzt
- Peter Carl (Dänemark) wechselt von GD Handel in die GD Umwelt (ab dem 21. November 2005)
- François Lamoureux (Frankreich GD Verkehr) wird die Kommission entgegen der Erwartungen Einiger nicht verlassen, sondern wird Ratgeber („hors classe“) von Kommissionspräsident Barroso
- Jean-Claude Demarty (Frankreich, derzeit stellv. Generaldirektor) wird zum Generaldirektor für Landwirtschaft befördert
- Heinz Zourek (Österreich, stellv. Generaldirektor) ist ab sofort Generaldirektor für Unternehmen
- Mike Leigh (Großbritannien übernimmt den Generaldirektorposten in GD Erweiterung
Insgesamt 16 Generaldirektor- und stellvertretende Generaldirektorposten sind als unbesetzt erklärt worden und sollen im nächsten Jahr über interne und externe Rekrutierungsverfahren besetzt werden, unter anderem in GD Binnenmarkt (wo Alexander Schaub im Juli 2006 in den Ruhestand geht), GD Verkehr und der Posten des Generaldirektors für Kommunikation.
Während die Umbesetzungen für Frauen relativ günstig ausgefallen sind, hat niemand aus den neuen EU-Mitgliedstaaten eines der Spitzenämter erhalten.
Außerdem hat die Kommission einen neuen Sprecher ernannt. Françoise Le Bail wird durch den Deutschen Johannes Laitenberger ersetzt, der derzeit in Barrosos Kabinett tätig ist. Françoise Le Bail wird stellvertretende Generaldirektorin in GD Unternehmen.



